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基于血清藥物化學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探究麝香通心滴丸治療冠心病的機(jī)制(一)

發(fā)布時(shí)間:2020-12-28 17:11 編輯者:夏德婷

目的基于血清藥物化學(xué)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探究麝香通心滴丸治療冠心病的機(jī)制。方法采用HPLC-Q-TOF/MS聯(lián)用技術(shù)分析麝香通心滴丸的入血成分。條件為Hydro-RP C18色譜柱(250 mm×4.6 mm,4μm);流動(dòng)相0.4%甲酸乙腈-0.2%甲酸,梯度洗脫;體積流量1.3 mL/min;進(jìn)樣量10μL。利用PharmMapper服務(wù)器、GeneCards數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)和篩選麝香通心滴丸入血成分治療冠心病的作用靶點(diǎn),String數(shù)據(jù)庫繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),Cytoscape軟件構(gòu)建成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖,借助David數(shù)據(jù)庫對(duì)靶點(diǎn)進(jìn)行GO分析和KEGG通路分析,使用Autodock Vina軟件對(duì)入血成分和核心靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接。結(jié)果共得到8種入血成分,涉及134個(gè)交集靶點(diǎn),可能通過ErbB signaling pathway、VEGF signaling pathway、PPARsignaling pathway等信號(hào)通路治療冠心病,且分子對(duì)接顯示入血成分與核心靶點(diǎn)結(jié)合性較好。結(jié)論麝香通心滴丸8種入血成分可能是其治療冠心病的物質(zhì)基礎(chǔ),可為深入闡明該制劑作用機(jī)制提供一定的依據(jù)。

“血清藥物化學(xué)”這一理論最先由德國(guó)科學(xué)家格哈德·多馬克所提出,后來我國(guó)科學(xué)家王喜軍教授提出符合中醫(yī)藥理論的中藥血清藥物化學(xué)。中藥成分較為復(fù)雜,經(jīng)口服給藥后,普遍認(rèn)為發(fā)揮藥效的活性成分應(yīng)該是被吸收入血的成分。通過分析口服給藥后血中成分,可確定中藥在體內(nèi)直接起作用藥效成分。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)通過生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)的連接和關(guān)系來分析藥物對(duì)疾病網(wǎng)絡(luò)的干預(yù),從整體效應(yīng)角度預(yù)測(cè)藥物靶點(diǎn),是闡明中藥復(fù)方作用機(jī)制的重要手段之一。近年來文獻(xiàn)報(bào)道的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究大多數(shù)是以各數(shù)據(jù)庫中成分的口服生物利用度為篩選指標(biāo)。然而多味中藥在組成復(fù)方后,其原本的一些成分在其它成分的協(xié)同作用下,會(huì)使其原本較低的生物利用度得到改善,并且更改相應(yīng)的藥物劑型也會(huì)提高其生物利用度。因此對(duì)于多成分的中藥復(fù)方制劑,僅靠數(shù)據(jù)庫中的口服生物利用度為篩選指標(biāo),會(huì)導(dǎo)致靶點(diǎn)預(yù)測(cè)不夠精確。麝香通心滴丸為內(nèi)蒙古康恩貝藥業(yè)有限公司圣龍分公司已上市產(chǎn)品,收載于2015年版《中國(guó)藥典》一部,于2017年1月13日被列入國(guó)家中藥保護(hù)品種,全方包括麝香、蟾酥、人參莖葉總皂苷、丹參、人工牛黃、熊膽粉、冰片,該品種屬于心腦血管領(lǐng)域用藥。雖然臨床上治療冠心病療效顯著,但其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)并不明確。本文通過HPLC-Q-TOF/MS對(duì)麝香通心滴丸進(jìn)行血清藥物化學(xué)研究,并基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)入血成分治療冠心病的作用機(jī)制進(jìn)行研究,為深入闡明麝香通心滴丸作用機(jī)制提供一定的依據(jù)。

1材料

1.1儀器

1260高效液相色譜儀、6530 Q-TOF/MS四極桿飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(美國(guó)安捷倫公司);高速冷凍離心機(jī)、渦旋振蕩器(美國(guó)賽默飛世爾科技公司);Sartorius BS210S十萬分之一電子天平(德國(guó)賽多利斯公司)。

1.2試劑與藥物

麝香通心滴丸(內(nèi)蒙古康恩貝有限公司圣龍分公司,批號(hào)180607)。蟾毒靈(批號(hào)111981-201501,純度99.2%)、熊去氧膽酸(批號(hào)110755-201704,純度99.4%)、脂蟾毒配基(批號(hào)110718-201809,純度98%)購自中國(guó)食品藥品檢定研究院;遠(yuǎn)華蟾毒精(批號(hào)PS010798,純度98%)、去乙酰華蟾毒精(批號(hào)PS010804,純度98%)購自成都普思生物科技股份有限公司;沙蟾毒精(批號(hào)5283,純度98%)、甘氨膽酸(批號(hào)6723,純度98%)購自上海詩丹德標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)服務(wù)有限公司;?;悄懰?批號(hào)PST190801-061,純度98%)購自成都樂美天醫(yī)藥科技有限公司。乙腈(批號(hào)SHBK3440,色譜純)、甲醇(批號(hào)10958407824,色譜純)購自默克化工技術(shù)(上海)有限公司。

1.3動(dòng)物

5只SPF級(jí)健康雄性SD大鼠,購自上海西普爾必凱實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司,生產(chǎn)許可證號(hào)SCXK(滬)2013-0016,由浙江中醫(yī)藥大學(xué)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中心代為飼養(yǎng),使許可證號(hào)SYXK(浙)2013-0184,條件為溫度(22±1)℃,相對(duì)濕度50%~60%,12 h光照,通風(fēng)頻率15~20次/h。大鼠以標(biāo)準(zhǔn)飼料喂養(yǎng),飲水自由,倫理審查決議編號(hào)ZSLL-2017-054。

2方法

2.1麝香通心滴丸入血成分分析

2.1.1麝香通心滴丸混懸液制備

取適量麝香通心滴丸粉研磨成粉末,加入適量0.5%羧甲基纖維素鈉溶液,調(diào)整質(zhì)量濃度為0.4 g/mL,即得,搖勻備用。

2.1.2動(dòng)物給藥與血清樣品采集

SD大鼠給藥前禁食12 h,自由飲水,以6.4 g/kg劑量給藥。給藥前采集空白血樣,在給藥15、30、45、60 min后眼眶取血各約0.5 mL,收集至EP管中靜置30 min,室溫下以3 000 r/min離心10 min,取上層血清,備用。

2.1.3血清樣本處理

分別精密吸取200μL空白血清和含藥血清(將“2.1.2”項(xiàng)下4個(gè)時(shí)間點(diǎn)含藥血清各吸取50μL混勻)于1.5 mL EP管內(nèi),加入5倍量甲醇渦旋5 min,離心(4℃、10 000 r/min)10 min,上清液于常溫下氮?dú)獯蹈桑?00μL甲醇復(fù)溶,渦旋5 min,離心(4℃、10 000 r/min)5 min,取上清液供MS分析。

2.1.4色譜條件

Hydro-RP C18色譜柱(250 mm×4.6 mm,4μm);流動(dòng)相0.4%甲酸乙腈(A)-0.2%甲酸水(B),梯度洗脫(0~5 min,5%A;5~13 min,5~20%A;13~40 min,20~22%A;40~60 min,22~45%A;60~75 min,45~75 A%);柱溫30℃;體積流量1.3 mL/min;進(jìn)樣量10μL。

2.1.5質(zhì)譜條件

離子源ESI,掃描方式ESI+、ESI-模式;干燥氣體溫度320℃,體積流量10 L/min;鞘氣溫度350℃,體積流量12 L/min;碎裂能量175 V;毛細(xì)管電壓3 kV;正負(fù)離子采集范圍m/z 50~1 500。

2.2網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究

2.2.1預(yù)測(cè)潛在靶點(diǎn)

將分析得到的麝香通心滴丸入血成分通過PubChem數(shù)據(jù)庫得到其mol2格式文件,并將其上傳至PharmMapper服務(wù)器(限定靶蛋白為人類,其余為默認(rèn)選項(xiàng)),采用“藥效團(tuán)匹配方法”得到虛擬篩選結(jié)果。將篩選出的分子-靶點(diǎn)匹配度(Fit Score)大于等于3的藥物靶點(diǎn)作為靶蛋白,并通過UniProt數(shù)據(jù)庫輸入篩選得到的蛋白靶點(diǎn)PDBID,經(jīng)檢索和轉(zhuǎn)化操作得到的麝香通心滴丸入血成分的潛在作用靶點(diǎn)。通過GeneCards數(shù)據(jù)庫,以“coronary atherosclerotic heart disease”為關(guān)鍵詞,檢索與冠心病相關(guān)的基因,并與上述成分靶點(diǎn)匹配進(jìn)行分析,篩選與麝香通心滴丸入血成分相關(guān)的作用靶點(diǎn)。

2.2.2蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析

String數(shù)據(jù)庫是一種包含已知和預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的數(shù)據(jù)庫,將上述成分-疾病交集靶點(diǎn)導(dǎo)入String數(shù)據(jù)庫,限定物種為人類(Homo sapiens),最低相互作用閥值設(shè)為高等置信度0.9“highest confidence”,同時(shí)顯示設(shè)置隱藏游離點(diǎn),然后下載PPI圖形件并保存tsv文件,最后使用R語言對(duì)得到的PPI進(jìn)行核心基因的篩選,其余參數(shù)保持默認(rèn)設(shè)置。

2.2.3靶標(biāo)GO富集分析和KEGG通路富集分析

本研究通過David 6.7數(shù)據(jù)庫,對(duì)成分-疾病交集靶點(diǎn)蛋白進(jìn)行GO富集分析、KEGG通路富集分析,其中GO富集分析包括生物過程(biological process)、分子功能(molecularfunction)和細(xì)胞組分(cellular component)3個(gè)部分,Select Identifier設(shè)置為Official GeneSymbol,List Type設(shè)置為Gene List,限定物種為人,并用FDR錯(cuò)誤控制法對(duì)P值作檢驗(yàn)校正,最終以“P<0.05”作為條件進(jìn)行篩選,篩選出具有顯著差異的代謝通路。

2.2.4入血成分與核心靶點(diǎn)的分子對(duì)接

對(duì)上述麝香通心滴丸的入血成分與核心靶基因進(jìn)行分子對(duì)接,首先通過PubChem數(shù)據(jù)庫得到各分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)式。在PDB數(shù)據(jù)庫檢索靶基因蛋白構(gòu)象,并根據(jù)以下條件篩選:通過X晶體衍射法獲取的蛋白結(jié)構(gòu);蛋白的晶體解析度小于3;分型明確的蛋白。然后,使用AutoTools對(duì)蛋白進(jìn)行加氫去除水分子預(yù)處理,AutoGrid進(jìn)行能量格點(diǎn)計(jì)算,AutodockVina進(jìn)行小分子與蛋白對(duì)接,對(duì)每個(gè)對(duì)接進(jìn)行結(jié)合能(affinity)評(píng)分,PyMoL作活性分子和蛋白的互相作用圖。

聲明:本文所用圖片、文字來源《中成藥》2020年10月,版權(quán)歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請(qǐng)與本網(wǎng)聯(lián)系

相關(guān)鏈接:甲酸,蟾酥羧甲基纖維素,晶體

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