2.2 稀釋曲線與Alpha多樣性分析

2.2.1稀釋曲線

從圖1(a)的Sobs 指數(shù)稀釋曲線可知，隨著測序數(shù)據(jù)量增加，Sobs 指數(shù)逐漸趨于平緩，說明測序數(shù)據(jù)量合理；Shannon多樣性指數(shù)曲線隨著樣本測序數(shù)據(jù)的增加，最終趨于平坦(圖1b)，說明測序數(shù)據(jù)能反映樣本中絕大多數(shù)的微生物多樣性信息。

2.2.2 Alpha多樣性分析

不同連作年限百香果土壤細(xì)菌多樣性指數(shù)如表2所示，其Coverage指數(shù)表示樣本的文庫覆蓋率，其數(shù)值越高，表示樣本中序列被測出的概率越高，如表2所示，各樣本Coverage指數(shù)均大于98%，說明各樣本細(xì)菌基因序列被檢出的概率較高，能較真實(shí)地反映樣本的細(xì)菌群落；Ace和Chao指數(shù)反映細(xì)菌群落的豐富度程度，指數(shù)值越高，樣本細(xì)菌豐富度越高；Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)反映樣本中細(xì)菌群落的多樣性程度，Shannon值越大，表明細(xì)菌多樣性越高，Simpson指數(shù)值越大，表明細(xì)菌優(yōu)勢度越高，均勻性越低，多樣性越低。各樣本Ace、Chao、Shannon和Simpson指數(shù)差異顯著(P<0.05)，如表2所示，隨著種植年限的增加，百香果種植土壤細(xì)菌的豐富度、多樣性指數(shù)均呈先增加后降低的趨勢，其中Ace和Chao指數(shù)在種植第二年時達(dá)到最大，Shannon多樣性指數(shù)在連作第三年時達(dá)到峰值，Simpson指數(shù)在前三年逐漸降低，連作4年時與撂荒地相近。上述結(jié)果說明連作能顯著影響百香果根區(qū)土壤細(xì)菌群落的多樣性。

聲明：本文所用圖片、文字來源《熱帶作物學(xué)報》，版權(quán)歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題，請與本網(wǎng)聯(lián)系刪除。

相關(guān)鏈接：土壤，細(xì)菌，樣本