北方偉業(yè)計(jì)量集團(tuán)有限公司
植物真菌病害是造成農(nóng)產(chǎn)品損耗的主要原因之一,在實(shí)際生產(chǎn)中造成了不可估量的經(jīng)濟(jì)損失。病原菌侵染植株后,使農(nóng)作物局部或整株感病,影響作物生長,嚴(yán)重時(shí)造成植株死亡,導(dǎo)致農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)量降低,品質(zhì)下降。多數(shù)病原菌不僅能在作物生長過程中影響植株?duì)顟B(tài),還在農(nóng)產(chǎn)品的運(yùn)輸過程中造成產(chǎn)品腐爛變質(zhì),是造成果蔬運(yùn)輸損耗的主要原因。此外,部分真菌病原菌能夠分泌真菌毒素,食用含有真菌毒素的果蔬能夠?qū)е禄セ蛘T發(fā)癌癥,威脅人類健康。如多種鏈格孢產(chǎn)生的鏈格孢毒素以及多種曲霉產(chǎn)生的伏馬霉素B。
幾丁質(zhì),是由N-乙酰基-D-葡萄糖胺(N-acetyl-D-glucosamine,GlcNAc)單體通過β-1,4-糖苷鍵連接的聚合物,也是病原真菌細(xì)胞壁的主要成分。在絲狀真菌中,幾丁質(zhì)和其他葡聚糖含量占細(xì)胞壁成分的70%以上,在部分酵母中,幾丁質(zhì)含量甚至達(dá)到細(xì)胞干重的10%~20%。幾丁質(zhì)酶可以通過外切和/或內(nèi)切水解酶作用將幾丁質(zhì)裂解為GlcNAc或GlcNAc的可溶性寡聚體。因此,以幾丁質(zhì)作為分子靶標(biāo),通過幾丁質(zhì)酶的水解作用來實(shí)現(xiàn)植物病害防治是植物病害控制的有效途徑。而生物防治因子分泌細(xì)胞壁裂解酶,裂解病原真菌細(xì)胞壁,也成為生物防治微生物拮抗植物病原真菌的主要機(jī)制之一。
煙管菌(Bjerkanderaadusta)屬于非褶菌目,多孔菌科,煙管菌屬。目前,對(duì)于煙管菌(Bjerkanderaadusta)的研究主要集中在環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域,但仍不乏煙管菌對(duì)植物真菌病害治理的研究報(bào)道。1982年,Dománski發(fā)現(xiàn)煙管菌能夠抑制櫟樹(Quercusrobur)褐腐病的發(fā)生。2011年,Bak等研究發(fā)現(xiàn)了煙管菌對(duì)歐美黑楊(Populuseuramericana)干腐病具有防控能力;2015年,汪華等人篩選出一株對(duì)水稻紋枯病菌或瓜亡革菌(Thanatephoruscucumeris)、大麗輪枝菌(Verticilliumdahliae)、茄科羅爾氏菌(Ralstoniasolanacearum)等引起的植物病害具有很好防治效果的煙管菌M-1;2017年,Zhang等人研究發(fā)現(xiàn)煙管菌能夠有效的抑制西瓜蔓枯病菌(Didymellabryoniae),并在2018年首次探究了煙管菌對(duì)核盤菌的抑制作用及其對(duì)油菜菌核?。⊿clerotiniasclerotiorum)的防治效果。但目前,仍然缺乏煙管菌生物防治機(jī)制研究。本研究結(jié)合抗病效果和RT-qPCR分析,首次從煙管菌中篩選并克隆出一個(gè)幾丁質(zhì)酶基因,并通過外源表達(dá)證明了該酶的抗真菌活性。推測該基因是煙管菌發(fā)揮生防作用過程中的細(xì)胞壁裂解酶基因。
本氏煙(Nicotianabenthamiana)。
煙管菌(Bjerkanderaadusta)菌株BK-1從四川省馬爾康市土壤中獲得,保藏于本實(shí)驗(yàn)室,ITS序列號(hào)為MW182414(NCBI)。鏈格孢(Alternariaalternata)菌株CD-1,鏈格孢蘋果?;停ˋlternariaalternataf.sp.mali)L-1,細(xì)極鏈格孢(Alternariatenuissima)SCAU-1和灰葡萄孢(Botrytiscinerea)DY-1均為本實(shí)驗(yàn)室保藏菌種。尖孢鐮刀菌(Fusariumoxysporum)(BNCCNO.143078),茄鏈格孢(Alternariasolani)(BNCCNO.337910)購自北納生物(BeNaCultureCollection,BNCC)。
PCR引物見表1及表2。
將灰葡萄孢,鏈格孢和細(xì)極鏈格孢轉(zhuǎn)接到PDA培養(yǎng)基中25℃活化培養(yǎng)7d,使用直徑為5mm的打孔器切取菌絲瓊脂塊作為接種物;煙管菌活化培養(yǎng)7d后,將5個(gè)直徑為5mm的煙管菌菌絲瓊脂塊接種至液體的100mLPDB培養(yǎng)基中25℃,180r/min活化培養(yǎng)7d后使用粉碎機(jī)打碎,制成煙管菌菌絲懸液作為抗菌液(AntiL)備用。
離體實(shí)驗(yàn):從生長30d的煙草植株上剪取健康的煙草葉片流水沖洗10min,使用保鮮膜封住葉柄切口處,放置于無菌水浸濕的三層濾紙上,在主葉脈兩側(cè)對(duì)稱位置分別涂抹50μL無菌水和煙管菌菌絲懸液后接種病原菌菌絲瓊脂塊作為對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組,每組6重復(fù)。再將葉片和濾紙放入上層開口的塑料盒中,上層使用保鮮膜封口保持盒內(nèi)濕潤。將其置于溫室內(nèi)(23℃,16h光照;18℃,8h黑暗),保持48h(細(xì)極鏈格孢侵染96h)后對(duì)煙草葉片進(jìn)行拍照記錄。
活體實(shí)驗(yàn):選取健康的煙草植株,將從上至下第4片葉片作為接種對(duì)象,接種方法同離體實(shí)驗(yàn)。將接種后的植株放置在密閉,透光且濕潤的育苗盆內(nèi),溫室培養(yǎng)48h(細(xì)極鏈格孢侵染96h)后拍照記錄。
上述實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)兩次,并使用ImageJ進(jìn)行葉片感病面積統(tǒng)計(jì)。
參考該菌株基因組相關(guān)信息(NCBIBioProjectID:PRJNA667319),使用SignalPv5.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)對(duì)其幾丁質(zhì)酶基因和β-1,3-糖苷酶基因進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測;并在NCBI數(shù)據(jù)庫(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)對(duì)幾丁質(zhì)酶的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比對(duì)。
將6種病原真菌和煙管菌接種到PDA培養(yǎng)基中,25℃避光條件下活化培養(yǎng)5d,使用打孔器取各菌落邊緣處直徑為5mm的菌塊。分別將煙管菌和一種病原菌接種到新的PDA培養(yǎng)基中,各距離平板邊緣2cm,并使兩菌塊保持在同一直徑線上25℃避光培養(yǎng)。
使用真菌RNA快速抽提試劑盒(生工),提取對(duì)峙培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中接種后第6d相互接觸區(qū)域菌絲的RNA,使用EasyScript©One-StepgDNARemovalandcDNASynthesisSuperMix(全式金)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲取cDNA.以cDNA為模板,以18SrRNA作為參考基因,使用2×T5FastqPCRMix(SYBRGreenII)試劑盒(擎科)對(duì)預(yù)測具有信號(hào)肽結(jié)構(gòu)的幾丁質(zhì)酶基因和β-1,3-糖苷酶基因進(jìn)行表達(dá)量測定。
使用高保真酶1-5TM2×Hight-FidelityMasterMix(MCLAB)擴(kuò)增去除信號(hào)肽區(qū)段的幾丁質(zhì)酶基因BaCHIB-T,并在C端添加6×His蛋白純化標(biāo)簽。以煙管菌cDNA為初始模板,后續(xù)PCR過程依次使用上一步擴(kuò)增產(chǎn)物為模板,得到目的片段BaCHIB-T,具體引物如下:①.BaCHIB-Cl-F/R;②.BaCHIB-Cl-F和His1-R;③.BaCHIB-Cl-F和His2-R;④.EcoRⅠ-T-F和NotⅠ-R。
使用限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ和NotI處理載體pPIC9K.利用同源重組試劑盒(諾唯贊)將BaCHIB-T與線性化的載體同源重組得到重組載體pPIC9K-BaCHIB-T(圖1),測序正確的表達(dá)載體使用限制性內(nèi)切酶salⅠ線性化,醋酸鋰轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化畢赤酵母(Pichiapastoris)GS115菌株。
蛋白的表達(dá)和純化按照Deng等的方法進(jìn)行,并進(jìn)行改進(jìn)。重組載體的表達(dá)菌株經(jīng)0.5%的甲醇誘導(dǎo)5d,相同處理的空載轉(zhuǎn)化菌株用于對(duì)照組。依次使用含有80,100,120,140mmol/L咪唑的磷酸鹽緩沖液(PBS)洗脫與柱結(jié)合的目標(biāo)蛋白。目的條帶經(jīng)SDS-PAGE電泳檢測。幾丁質(zhì)酶活性測定使用幾丁質(zhì)酶活性檢測試劑盒(索萊寶)。
純化后的重組蛋白,濃度調(diào)整為200μg/mL進(jìn)行抗真菌活性檢測。從活化5d的鏈格孢,茄鏈格孢和灰葡萄孢的平板邊緣切取兩塊邊長約為5~10mm的正方形菌絲瓊脂塊,并將其置于2mL離心管中。每管加入400μL純化蛋白溶液作為實(shí)驗(yàn)組,等量蛋白洗脫液作為對(duì)照組25℃暗培養(yǎng)48h后,觀察菌絲生長狀況。
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